Au Moyen-Age, le village de Saint Jean d'Alcas appartient à l'abbaye. Pendant la guerre de Cent Ans, l'abbaye sert de refuge et des fortifications y sont alors érigées. A la fin du XXe siècle, une restauration du fort commence et bénéficie de la signature du contrat de site majeur Templiers et Hospitaliers.
Dans la grange cistercienne, toute la vie est centrée sur la cour de ferme fermée par les bâtiments.
Au début du XXe siècle, les bergeries voûtées, surmontées de granges en arceaux complètent les anciens bâtiments et abritent un important troupeau de brebis dont le lait est destiné aux caves de Roquefort.
D'après un inventaire de 1823, le domaine se compose de plus de 326 hectares. Plusieurs familles se succèdent à la tête du domaine, dont la famille de M. Arnal, tanneur au Monastère sous Rodez. Plus tard les terres sont vendues au agriculteurs alentours et le château de Lioujas demeure une propriété privée.
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